11.01.2021
HLA-типирование с полным покрытием области генов MHC¹ — Holotype HLA
Мультиплексное HLA-типирование с полным покрытием области генов MHC — OmniType
HLA-типирование отдельных локусов — Monotype HLA
Omixon представляет наборы для HLA-типирования —
Holotype HLA,
OmniType и
Monotype HLA, отличающиеся высокой точностью и большой производительностью. Наборы работают на платформе
Illumina и поставляются в комплекте со специально разработанным ПО для интерпретации результатов секвенирования
HLA Twin.
|
Наборы
|
Локусы
|
Кол-во образцов
в наборе
|
Кол-во образцов
за 1 прогон
|
Holotype HLA
OmniType
|
5 локусов
|
A, B, C, DRB1, DQB1
|
96
|
288
|
|
7 локусов
|
5 + DQA1, DPB1
|
24/96
|
192
|
|
11 локусов
|
7 + DRB3/B4/B5, DPA1
|
24/96
|
96
|
|
Holotype HLA
|
Custom Loci
|
пользовательский выбор
|
24/96
|
на выбор
|
¹
MHC, Major Histocompatibility Complex - главный комплекс гистосовместимости
Holotype HLA — до 96 образцов по 11 локусам HLA.
От подготовки геномной ДНК до обработки результатов менее 48 часов!
Набор
Holotype HLA позволяет провести HLA-типирование по 5, 7 или 11 локусам HLA одновременно у 24 или 96 образцов на основе NGS на платформах
iSeq,
MiniSeq,
MiSeq,
NextSeq.
Holotype HLA обеспечивает полное и равномерное покрытие всей области генов MHC с анализом распределения аллелей в одном локусе, между локусами в одном образце и между образцами в целом.
Простой протокол рабочего процесса позволяет получить результаты менее, чем за 48 часов.
Holotype HLA соответствует стандарту ISO-13485:2016, возможна маркировка CE-IVD.
Holotype HLA поставляется в комплекте с ПО
HLA Twin. Достоверность интерпретации результатов обеспечивается двумя независимыми алгоритмами консенсусного и статистического генотипирования. Также ПО
HLA Twin даёт возможность выявления нулевых и новых аллелей генов MHC.
HLA-типирование: NGS с наборами Omixon
OmniType — мультиплексное генотипирование локусов HLA.
От геномной ДНК до библиотеки менее чем за 1 день!
Набор
OmniType предназначен для мультиплексного анализа до 96 образцов по 11 локусам HLA на платформах
Illumina iSeq,
MiniSeq,
MiSeq,
NextSeq.
В отличии от
Holotype HLA при использовании набора
OmniType амплификация локусов HLA проводится в одной общей пробирке, что позволяет получить библиотеку ДНК менее чем за 6 часов, и уже на следующий день анализировать результаты секвенирования.
OmniType обеспечивает полное геномное покрытие всей области генов MHC.
Анализ результатов проводится также с помощью ПО
HLA Twin, поставляемым в комплекте с набором.
Набор
OmniType — только для исследовательских целей (по состоянию на январь 2021 года).
Monotype HLA — анализ отдельных локусов HLA
|
Набор Monotype HLA предназначены для типирования отдельных локусов HLA. Monotype HLA используется для выявления моногенных заболеваний, исследований в области популяционной генетики и тестирования чувствительности к лекарственным средствам.
Два формата: для одновременного анализа 24 или 96 образцов. Интерпретация результатов проводится с помощью ПО HLA Twin, поставляемым в комплекте.
|
Компания Omixon также предлагает ПО HLA Explore для анализа результатов типирования HLA на платформах Illumina, Ion Torrent, PacBio, Nanopore при любом типе эксперимента: анализе целевых экзонов, генов, целого МНС или транскриптома, экзома или генома.
Т.е. для интерпретации результатов могут использоваться данные таргетного, экзомного или полногеномного секвенирования.
|
|
Цена
в валюте производителя /
в рублях
|
|
|
HLA 24/7
|
|
24 образца
|
|
|
|
РУ
Регистрационное удостоверение на медицинское изделие
Росздравнадзора
|
|
|
|
|
|
|
Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.
Подготовка образцов
- Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
- для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
- исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
- одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².
Подготовка библиотеки
- Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
- получение результатов менее чем за 48 часов;
- библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.
Секвенирование
- Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
- наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
- поддерживается химия на 300 и 500 циклов.
Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN
- Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
- время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
- два независимых алгоритма генотипирования;
- 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
- сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
- глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.
Технические характеристики Набора Holotype HLA 24/7
- Набор Holotype HLA 24/7 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 24-луночный планшет для подготовки библиотеки;
- один набор рассчитан на анализ 24 образцов;
- типирование по 7 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DPB1, DQA1, DQB1 и DRB1);
- набор Holotype HLA 24/7 может быть выполнен в одной из 4-х конфигураций, A1, A2, A3, A4, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A1 стандартная идентификация от 1 до 24, в А2 – от 25 до 48, в А3 — от 49 до 72, в А4 — от 73 до 96. Совместное использование 4-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 96 образцов;
- ПО в комплекте;
- наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).
|
|
|
|
См. также
Гомогенизаторы FastPrep
Гомогенизаторы ультразвуковые для нарезки ДНК
Гомогенизаторы универсальные UltraTurrax Tube Drive
ДНК-амплификаторы "классические"
Флуориметры детекторы ПЦР
Электрофорез горизонтальный
Гель- и хемидокументирующие системы
Электрофорез капиллярный на чипе
Электрофорез препаративный
ДНК-амплификаторы "в реальном времени"
Станции для автоматической подготовки библиотек NGS
Секвенаторы ДНК 2-го поколения NGS
